Pada 31.1.64, Persidangan pertama Muktamar Islam Asia Tenggara dan Timur Jauh diadakan di Kuala Lumpur. Persidangan ini telah dirasmikan oleh Perdana Menteri Malaysia Tunku Abdul Rahman Putra Al-Haj. Persidangan ini telah membincangkan perkara seperti masalah kemasyarakatan yang berkaitan dengan agama, pelajaran dan ekonomi umat Islam di Asia Tenggara dan Timur Jauh.

Cara-cara menghadapi dan menolak pengaruh fahaman tidak bertuhan dan perkembangan agama bukan Islam, aktiviti-aktiviti Mubaligh Islam di Asia Tenggara dan Timur Jauh, penubuhan Lembaga Penasihat Hal Ehwal Agama Islam bagi umat Islam di Asia Tenggara dan Timur Jauh.